Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr1bP70700 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr1bP70700 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms