Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113P62684 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113P62684 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms