Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A2P52657 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A2P52657 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms