Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEK4P51957 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEK4P51957 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms