Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA2P51531 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA2P51531 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.6 ms