Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUP153P49790 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUP153P49790 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUP153P49790 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUP153P49790 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUP153P49790 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUP153P49790 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUP153P49790 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP153P49790 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP153P49790 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP153P49790 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP153P49790 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP153P49790 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NUP153P49790 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUP153P49790 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUP153P49790 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUP153P49790 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP153P49790 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms