Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp4P35123 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms