Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC1P33527 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC1P33527 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms