Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C4BP0C0L5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C4BP0C0L5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms