Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopeO89079 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CopeO89079 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CopeO89079 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CopeO89079 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopeO89079 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopeO89079 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopeO89079 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopeO89079 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopeO89079 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopeO89079 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopeO89079 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms