Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEBLO76041 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEBLO76041 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NEBLO76041 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEBLO76041 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEBLO76041 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms