Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CREB3O43889 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CREB3O43889 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CREB3O43889 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms