Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3EO15041 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3EO15041 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms