Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms