Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms