Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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