Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SS18Q15532 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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SS18Q15532 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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SS18Q15532 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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SS18Q15532 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SS18Q15532 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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SS18Q15532 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SS18Q15532 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SS18Q15532 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SS18Q15532 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SS18Q15532 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SS18Q15532 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SS18Q15532 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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