Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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