Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHD4Q14839 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms