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| FHL3 | Q13643 | CRB1-211 | ENST00000638467 | 4348 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | CREM-203 | ENST00000344351 | 1625 nt | TSL 2 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | PLEKHA5-202 | ENST00000424268 | 4391 nt | TSL 2 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | TEAD1-203 | ENST00000526600 | 8477 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
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| FHL3 | Q13643 | 5S_rRNA.28-201 | ENST00000638107 | 119 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC092375.1-202 | ENST00000639452 | 404 nt | TSL 3 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | PMCHL1-201 | ENST00000418902 | 1917 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | IFIT1B-201 | ENST00000371809 | 1972 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | AHNAK2-201 | ENST00000333244 | 18254 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF215-205 | ENST00000529903 | 1396 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC011978.2-201 | ENST00000569835 | 2054 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | EDA2R-204 | ENST00000451436 | 3464 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | MOB1B-201 | ENST00000309395 | 6963 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | PLCE1-203 | ENST00000371385 | 6500 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | CR1-201 | ENST00000367049 | 7470 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | EVI2A-202 | ENST00000461237 | 1540 nt | APPRIS ALT2 TSL 4 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | KARSP3-201 | ENST00000571212 | 1504 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | DDX4-202 | ENST00000354991 | 2324 nt | TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | LINC02510-201 | ENST00000509798 | 1576 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | RORB-201 | ENST00000376896 | 9551 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | MUC5AC-201 | ENST00000621226 | 17448 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF146-201 | ENST00000443387 | 3326 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | OR7C1-204 | ENST00000642000 | 11290 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | C1orf27-201 | ENST00000287859 | 3792 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | PDE4D-228 | ENST00000636120 | 6659 nt | TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | MECOM-217 | ENST00000494292 | 3939 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | VPS13B-202 | ENST00000357162 | 14019 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | PDE1A-202 | ENST00000358139 | 2015 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | RAP1GDS1-202 | ENST00000339360 | 2092 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| FHL3 | Q13643 | IPCEF1-203 | ENST00000422970 | 3267 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |