Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SF3B2Q13435 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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