Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CASQ1P31415 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CASQ1P31415 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CASQ1P31415 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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