Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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