Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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UBXN4Q92575 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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UBXN4Q92575 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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UBXN4Q92575 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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UBXN4Q92575 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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UBXN4Q92575 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
UBXN4Q92575 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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