Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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