Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHRNA6Q15825 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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