Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms