Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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ATP1A4Q13733 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ATP1A4Q13733 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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