Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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