Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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