Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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