Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms