Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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