Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TRIM47Q96LD4 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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TRIM47Q96LD4 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TRIM47Q96LD4 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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TRIM47Q96LD4 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TRIM47Q96LD4 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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TRIM47Q96LD4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM47Q96LD4 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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