Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms