Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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RTL8BQ17RB0 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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