Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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