Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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