Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGB3BPQ13352 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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