Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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