Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPN13Q12923 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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