Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC026746.1-201ENST00000505623 2105 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC012467.2-201ENST00000607783 2583 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GABRR1-202ENST00000435811 3106 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 VTRNA1-2-201ENST00000365241 89 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL136380.2-201ENST00000411837 492 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LINC00630-202ENST00000420471 838 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL391825.1-202ENST00000458136 741 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC013452.1-201ENST00000560630 598 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL023284.4-201ENST00000564248 374 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC007614.1-201ENST00000566607 309 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SL203P-201ENST00000579600 296 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC087289.3-203ENST00000587556 550 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 NYAP2-201ENST00000272907 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AKAP2-201ENST00000259318 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L26-202ENST00000610514 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L20-202ENST00000613757 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L11-202ENST00000613973 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L17-202ENST00000614762 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L19-202ENST00000615989 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L13-202ENST00000616303 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L18-202ENST00000619296 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L25-202ENST00000621472 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L22-202ENST00000622009 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 USP17L24-202ENST00000622713 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MAPK10-248ENST00000640490 2715 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 FRMD6-201ENST00000344768 2972 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC242426.2-201ENST00000446956 795 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC087501.2-201ENST00000466869 581 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AL096701.3-202ENST00000483736 615 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC055716.1-201ENST00000550077 495 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC007952.7-201ENST00000583141 757 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ZSCAN30-210ENST00000601405 510 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC119619.1-201ENST00000619728 112 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 TPH2-201ENST00000333850 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 SP140L-201ENST00000243810 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 ITPRIPL1-201ENST00000361124 4295 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CACNB1Q02641 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms