Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms