Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD13P35453 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms