Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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