Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms