Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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