Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTNNA3Q9UI47 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms