Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDGFDQ9GZP0 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms