Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NLRP3Q96P20 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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